Les microscopes USB sont des microscopes numériques utilisés en laboratoire. Ils peuvent servir à différentes tâches comme par exemple l'observation :
Les microscopes USB peuvent avoir un format classique avec un pied, une platine d'observation et un ou deux oculaire(s). Ils peuvent aussi avoir un format compact et se tenir à une main comme un stylo. Dans ce cas, dépourvu d'oculaire ou d'écran intégré, l'observation se fait sur l'écran auquel le port USB est connecté (moniteur, tablette, smartphone,...). Il existe des modèles intermédiaires qui peuvent soit être au format compact mais se fixer sur un socle adapté, soit avoir un format plus classique mais être suspendu à un pied réglable et léger plutôt que fixé sur un socle.
La capacité de grossissement dépend de l'application du microscope : il peut aller jusqu'à 600 fois pour bénéficier d'un maximum de détails sur le rendu. La plupart des applications peuvent toutefois se contenter d'un grossissement moindre.
Beaucoup de modèles de microscopes USB sont équipés d'une lampe à LED pour éclairer la surface à observer. Ce système de lumière intégrée évite de recourir à une source lumineuse externe.
Le taux de rafraîchissement définit le nombre d'images par seconde affichées par le microscope. Si la plupart des microscopes numériques affichent 30 images par seconde, soit un taux de rafraîchissement confortable pour l'œil humain et compatible avec tous les écrans, on trouve des modèles plus avancés proposant deux fois plus d'images par seconde.